Аэробная и факультативно анаэробная микрофлора что это
Аэробная и факультативно анаэробная микрофлора что это
Это микробиологическое исследование, позволяющее определить качественный и количественный состав микрофлоры исследуемого биоматериала, в том числе выявить условно-патогенные микроорганизмы в высоком титре и патогенные микроорганизмы, определить их чувствительность к антибиотикам и бактериофагам.
При обнаружении микробиологическим методом микроорганизмов, составляющих нормальную микрофлору, или условно-патогенных микроорганизмов в титре менее диагностического не определяется чувствительность к антибиотикам и бактериофагам, так как это количество не является значимым и не требует лечения противомикробными препаратами.
К анаэробной флоре относятся актиномицеты, бактероиды, клостридии, эубактерии и фузобактерии, пептострептококки, пропионобактерии, вейлонеллы, превотеллы, гемеллы, порфиромонады, бифидобактерии.
Бактериологический посев на флору.
Culture, routine. Bacteria identification, bacteriophage and antibiotic susceptibility testing.
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Аспират из полости матки, биоптат, выделения из молочной железы, грудное молоко, материал из дренажа, содержимое желудка, желчь, содержимое желчного пузыря, мазок из зева (ротоглотки), мазок с конъюнктивы, мазок из носа, мазок из носоглотки, мазок из носовых пазух, мазок урогенитальный, мазок урогенитальный (с секретом предстательной железы), мазок из уретры, мазок с внутренней поверхности шейки матки (из цервикального канала), мокрота, постмассажная порция мочи с секретом предстательной железы, отделяемое абсцесса полости рта, отделяемое влагалища, отделяемое уха, плевральная жидкость, синовиальная жидкость, смыв из бронхов, соскоб с кожи, средняя порция утренней мочи, экссудат, эякулят.
Как правильно подготовиться к исследованию?
Общая информация об исследовании
Нормальная микрофлора человека представляет собой совокупность микроорганизмов, населяющих кожу и слизистые оболочки человека. Наибольшее их количество (около 40 %) обитает в желудочно-кишечном тракте, остальная часть – на кожных покровах, зеве, глотке, в мочеполовой системе и др. Нормальная микрофлора подразделяется на постоянную (составляет до 90 % присутствующих в организме микробов), факультативную (менее 10 %) и случайную (не более 0,5 %).
По способности вызывать инфекционные заболевания микроорганизмы классифицируют на непатогенные (не вызывающие заболевания), условно-патогенные (в норме могут выделяться в небольших количествах и при определенных условиях активно размножаются, приводя к воспалению) и патогенные (являются возбудителями инфекционных заболеваний и в составе нормальной микрофлоры не обнаруживаются).
Бактериологическое исследование (посев на флору) позволяет определить качественный и количественный состав микрофлоры исследуемого клинического материала, в том числе выявить патогенные микроорганизмы. При обнаружении условно-патогенных микроорганизмов в высоком титре или патогенных микроорганизмов определяется их чувствительность к антимикробным препаратам (антибиотикам и бактериофагам).
Для чего используется исследование?
Когда назначается исследование?
При воспалительных заболеваниях различных локализаций (за исключением воспалительных заболеваний кишечника).
Что означают результаты?
Референсные значения для различных видов микроорганизмов зависят от их локализации (точки взятия биологического материала).
Что может влиять на результат?
Предшествующая противогрибковая или антибактериальная терапия.
Кто назначает исследование?
Терапевт, врач общей практики, педиатр, хирург, ЛОР, пульмонолог, уролог, гинеколог, дерматовенеролог, офтальмолог.
Анаэробные и аэробные микроорганизмы (бактерии): в чем их различие?
Бактерии живут во всем окружающем нас мире, в земле, воздухе, на вашем рабочем столе и экране телефона. Основная классификация бактерий основана на том, необходим ли им кислород для жизнедеятельности или нет.
Анаэробные бактерии
Анаэробные бактерии не нуждаются в кислороде и способны жить в различных средах, где нет света и кислорода, например, в почве, в желудочно-кишечном тракте животных и человека и т.д. Анаэробные бактерии отвечают за гниение, процессе их деятельности органические соединения постепенно разлагаются с выделением метана, который и является причиной неприятного гнилостного запаха.
Анаэробные бактерии царствуют в пластиковых септиках
Именно анаэробные микроорганизмы вызывают воспалительно-гнойные заболевания различных видов:
Однако другой подвид анаэробных бактерий также являются частью нормальной микрофлоры кишечника человека и полости рта. Таким образом, различные подвиды анаэробов могут быть как полезными, так и опасными для человека.
Аэробные бактерии
С помощью постоянной подачи кислорода и поступления органических отходов в станцию биологической очистки, поддерживается существование колонии аэробных бактерий. После переработки сточных вод, чистая вода из автономной канализации удаляется в канаву или дренажный колодец, а активный ил оседает на дне и стенках станции. Активный ил достаточно чистить раз в 3-6 месяцев, в зависимости от активности эксплуатации. Сточные воды очищаются до 98% и чистая вода из станции может использоваться для полива не плодовых деревьев, газонов, мытья дорожек, веранды или машины.
Как попадают бактерии в автономную канализацию
Бактерии в автономной канализации появляются естественным образом после начала ее использования, дополнительное добавление бактерий в нее не требуется. При грамотной установке и эксплуатации согласно рекомендациям производителя, в дальнейшем покупка бактерий также является лишней тратой денег. Первым признаком неправильной работы станции является сильный гнилостный запах из нее, если его нет, то бактерии в вашей станции отлично справляются со своей задачей. В случае появления неприятного запаха из канализации, обратитесь в компанию, которая производила установку станции, возможно, дело вовсе не в гибели бактерий, а в поломке какой-либо системы.
Микробиологическое (культуральное) исследование на аэробную и факультативно-анаэробную флору с определением чувствительности к основному спектру антимикробных препаратов (Пункционная жидкость, собранная в транспортную среду)
Исследование позволяет оценить качественный и количественный состав аэробной и факультативно-анаэробной микрофлоры исследуемого биоматериала. Нормальная микрофлора человека представляет собой совокупность различных микроорганизмов. При развитии патологических процессов состав микрофлоры изменяется в сторону увеличения условно-патогенных и/или появления патогенных возбудителей.
Исследование направлено на обнаружение роста возбудителей гнойно-септических процессов: стафилококков (Staphylococcus aureus); стрептококков (групп А, В, С, F, G, в том числе Streptococcus agalactiae (group B), Streptococcus pyogenes (group A), и др.); энтеробактерий (родов Escherichia, Klebsiella, Enterobacter, Proteus и др.); неферментирующих грамотрицательных бактерий (родов Pseudomonas, в том числе Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter, Moraxella и др.); энтерококков (Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium и др.).
Культуральные исследования выполняются с применением высококачественных транспортных и питательных сред ведущих мировых производителей. Идентификацию выделенных микроорганизмов проводят с применением технологии лазерной времяпролетной масс-спектрометрии («MALDI-TOF MS», Microflex LT, Bruker, Германия). На следующем этапе лабораторного исследования выполняется определение чувствительности возбудителя к антимикробным препаратам на современных микробиологических анализаторах. Выбор спектра зависит от выявленного возбудителя, интерпретация определения чувствительности соответствует стандартам EUCAST (Европейский комитет по определению чувствительности к антимикробным препаратам (European Committee Antimicrobial Susceptibility Testing)).
Чувствительность микроорганизмов к основному спектру выполняется диско-дифузионным методом, и включает в себя антимикробные препараты основного ряда. Чувствительность микроорганизмов к расширенному спектру выполняется на автоматическом анализаторе VITEK 2. Автоматическая экспертная система анализатора прогнозирует эффективность применения различных групп антимикробных препаратов в зависимости от выявленного штамма микроорганизма.
Наличие симптомов инфекционно-воспалительных заболеваний;
Подбор антибактериальной терапии;
Оценка эффективности антибактериальной терапии.
Условия подготовки определяются лечащим врачом. Взятие материала рекомендуется проводить до начала антибактериальной терапии или не ранее, чем через две недели после ее окончания.
Внимание! Для хранения и транспортировки пункционной жидкости лаборатория CMD предоставляет специальные расходные материалы: коллектор транспортный с жидкой средой Эймса (зонд-тампон стандартный), контейнер пластиковый универсальный, 60 мл. Перед обращением к врачу для проведения пункции их необходимо получить в ближайшем офисе.
Взятие биоматериала производит врач в соответствии с методикой для конкретного локуса.
Доставка в лабораторию в день взятия биоматериала при Т=+2+25 °С в коллекторе. Замораживание образцов недопустимо!
Для данного исследования лаборатория принимает следующий биоматериал:
Спинномозговая жидкость
Плевральная жидкость
Синовиальная жидкость
Асцитическая жидкость
Сдать посев на флору
Исследуемый биоматериал | Мазок/отделяемое из уретры, Мазок/отделяемое из влагалища, Мазок/отделяемое шейки матки, Аспират полости матки, Эякулят, Другое (указать в примечании), Другое (указать в примечании), Моча (после массажа простаты), Секрет предстательной железы, Мазок/отделяемое из цервикального канала |
Cрок исполнения с момента поступления биоматериала в лабораторию | 6 к.д. |
Описание
Микрофлора влагалища представлена различными бактериями. Выделяют нормофлору и условно-патогенную флору.
К нормофлоре можно отнести лактобактерии. Это полезные бактерии, которые создают собственную защиту, поддерживают местный иммунитет, подавляют возможное воспаление и даже препятствуют попаданию и развитию патогенной флоры. Лактобактерии при этом достаточно чувствительны к изменениям условий среды. Так для их правильного развития и роста должно быть достаточно гликогена. Это специальный субстрат, который выступает в качестве питания, обеспечивая при этом должный уровень молочной кислоты. От этого будет зависеть кислотность влагалища. Так, рН среды в репродуктивном возрасте является слабокислой. Возраст имеет принципиальное значение, гормональное влияние распространяется также на концентрацию гликогена, а, следовательно, может приводить к нарушению правильного равновесия. Именно поэтому существуют особенности качественного и количественного состава микрофлоры влагалища в зависимости от периода в жизни женщины. Но во всех случаях крайне важно понимать, имеет ли место чрезмерный рост условно-патогенной флоры или недостаток нормофлоры.
Если количество лактобактерий снижается, то одновременно возрастает концентрация облигатных анаэробов, аэробов, факультативных анаэробов. Такие перемены могут приводить к воспалению, вызывать дисбиоз. В свою очередь данные состояния вызывают ряд жалоб у женщин:
· Обильные выделения различного характера
Чтобы устранить перечисленные жалобы, важно сперва выявить причину. Для этого могут быть предложены различные исследования. Одним из наиболее показательных является посев отделяемого влагалища на флору. Данное исследование основано на выявлении роста нормофлоры и условно-патогенной флоры (исключая уреамикоплазмозы). Таким образом можно определить количество бактерий различных групп: энтеробактерий (родов Escherichia, Klebsiella, Enterobacter, Proteus и др.); неферментирующих грамотрицательных бактерий (родов Pseudomonas, в т.ч. Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter, Moraxella и др.); стрептококков (Streptococcus agalactiae (group B), Streptococcus pyogenes (group A) и др.); энтерококков (Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium и др.); стафилококков (Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus saprophyticus и др.). Следует отметить, что условно-патогенная флора отличается тем, что в определенном количестве данные бактерии могут присутствовать. Когда определяется нормальная концентрация условно-патогенной флоры, говорят о клинически незначимых титрах. Предположительно, микроорганизмы в таком количестве не могут стать причиной жалоб или клинической картины. Но не следует забывать об индивидуальных особенностях, поэтому в результатах посева на флору отражается вся определившаяся флоры.
Так как любой микроорганизм может быть подавлен действием антимикробного препарата, в исследования включено определение чувствительности к основному спектру антибиотиков.
Подготовка
За сутки до забора материала следует исключить половые контакты
· Исследование не проводится в дни менструации
· В ходе подготовки к исследованию не следует проводить спринцевания и использовать вагинальные формы лекарственных средств
· Непосредственно перед анализом не следует проводить какие-либо гигиенические процедуры
· Также перед анализом не проводятся иные методы диагностики, способные исказить результаты посева, например, кольпоскопия, забора материала при помощи цитощеток, способных травмировать слизистую
Показания
· Наличие вышеперечисленных жалоб для выявления возможного возбудителя
· Для подбора рациональной антимикробной терапии
· При необходимости оценки эффективности проводимого лечения
Интерпретация результата
При наличии микрофлоры в клинически значимом количестве анализ отражает не только титр данного вида бактерий, но и чувствительность их к ряду антимикробных препаратов. В иных случаях, когда концентрация бактерий мала, определение чувствительности не проводится. Также не оценивают чувствительность лактобактерий к антибиотикам, так как они представляют собой нормальную флоры, которая не требует коррекции.
Аэробная и факультативно анаэробная микрофлора что это
В составе микрофлоры влагалища девочек препубертатного возраста (9–12 лет) вплоть до менархе преобладают анаэробные и микроаэрофильные микроорганизмы: бактероиды, стафилококки, дифтероиды. Отмечают большое количество лактобактерий и молочнокислых стрептококков. В этот период микробиоценоз влагалища относительно стабилен. C момента активации овариальной функции организм девушки синтезирует «собственные», эндогенные эстрогены. Под влиянием эстрогенов клетки эпителия влагалища накапливают гликоген. Это приводит к формированию эстрогенстимулированного эпителия. На поверхности эпителиоцитов влагалища увеличено число рецепторных участков для адгезии лактобактерий, увеличивается толщина эпителиального слоя. С этого момента лактобактерии — доминирующие микроорганизмы микрофлоры влагалища, и в последующем они сохранят это положение на протяжении всего репродуктивного периода. Метаболизм лактобактерий способствует стабильному сдвигу рН среды влагалища в кислую сторону до 3,8–4,5. Общее микробное число составляет 10 5 –10 7 КОЕ/мл.
Пубертатный, или подростковый, период характеризует ритмичная физиологическая гипертранссудация в виде слизистых выделений. Увеличено количество эпителиальных слоев, а кольпоцитологическая картина приближена к таковой у взрослой женщины. Общее микробное число составляет 10 5 –10 7 КОЕ/мл. В 60% случаев определяют лактобациллы, среда влагалища становится кислой, рН 4,0–4,5 [4, 10, 11].
На современном этапе много исследований посвящено изучению микроценоза влагалища, но наряду с этим крайне мало данных о видовом соотношении микроорганизмов. Учитывая важность учета количественного состава аэробных и анаэробных сообществ для дифференциальной диагностики патологических состояний в детском возрасте, нами проведено исследование, целью которого стало изучение частоты встречаемости, а также соотношение аэробной, факультативно анаэробной микрофлоры, облигатного сообщества микроорганизмов влагалища и факультативных анаэробов в различные периоды полового созревания.
Задачи
Материалы и методы исследования
Взятие биоматериала осуществлялось на базе детского поликлинического отделения № 1 ГБУЗ СО СГП № 13 с февраля по август 2015 г., при подписании пациенткой или законным представителем информированного согласия на проведение исследования.
Количество обследованных девочек составило 226 человек, из них девочек от 0 до 7 лет – 74 человека, от 8 лет до менархе – 37, от менархе до 18 лет – 115. Критерии возрастного интервала выбранных групп были обусловлены основными этапами формирования репродуктивной системы.
Критерии включения: здоровые девочки, проходившие профилактический осмотр с отсутствием жалоб, неизмененной слизистой влагалища, а также физиологическими выделениями из половых путей.
Критерии исключения: применение антибактериальных препаратов за месяц до обследования, отсутствие тяжелой экстрагенитальной патологии и наличие острых воспалительных заболеваний на момент осмотра и забора материала.
Исследование состояния влагалищного микробиоценоза проводили при помощи комплексной количественной полимеразной цепной реакции (ПЦР) с использованием тест-систем «Фемофлор-17» (производства ООО «НПО ДНК-Технология», Россия).
Материалом для исследования методом комплексной количественной ПЦР у девочек являлся соскоб эпителиальных клеток, который забирался из заднего свода влагалища через гименальное кольцо. Хранение материала осуществлялось при температуре 2–8°С не более 8 ч, далее при температуре –20°С в течение 1 месяца или при температуре –70°С в течение 1 года.
Всего исследовано 226 образцов соскобов отделяемого слизистой влагалища. Спектр диагностируемых показателей включал КВМ (контроль взятия материала), ОБМ (общая бактериальная масса), наличие микоплазм (Mycoplasma hominis, Ureaplasma spp.), дрожжеподобных грибов (Candida spp.); Lactobacillus spp., (Enterobacterium spp., Streptococcus spp., Staphylococcus spp.), (Gardnerella vaginalis/Prevotella bivia/Porphyromonas spp., Eubacterium spp., Sneathia spp./Leptotrichia spp./Fusobacterium spp., Megasphaera spp./Veillonella spp./Dialister spp., Lachnobacterium spp./Clostridium spp., Mobiluncus spp./Corinebacterium spp., Peptostreptococcus spp., Atopobium vaginae), а также идентификацию патогенов (Mycoplasma genitalium).
Заключение по результатам диагностического теста Real-Time PCR получали в виде диаграммы, которая описывала вид микробной флоры влагалища.
Рассчитывали абсолютные (в логарифмах полученных показателей бактериальной массы условно-патогенного организма Lg10УПМ) и относительные показатели (разница логарифмов полученных показателей общей бактериальной массы условно-патогенного организма (УПМ) и общей бактериальной массы (ОБМ) — Lg10УПМ – Lg10ОБМ). Оценку наличия Candida spp., Mycoplasma hominis, Ureaplasma spp., Mycoplasma genitalium проводили только в абсолютных показателях.
При оценке состава условно-патогенной флоры учитывалось не только ее присутствие, но и количество по отношению к общей бактериальной массе (ОБМ). Также определялось количество лактобактерий по отношению к общей бактериальной массе.
Статистическая обработка данных проводилась с использованием компьютерного программного пакета (Microsoft Office Excel 2007).
Результаты исследования
Проанализировав частоту встречаемости и количественное содержание аэробной и факультативно анаэробной микрофлоры, облигатного сообщества микроорганизмов влагалища и факультативных анаэробов, мы определили, что у девочек нейтрального возраста микрофлора влагалища характеризуется преобладанием облигатных анаэробов (табл. 2), Lg10 которых соответствует 5,87±0,13. Относительное содержание данной группы микроорганизмов в этом возрастном периоде 92,24±2,19. Аэробы и факультативные анаэробы встречаются в микроценозе влагалища в 71,6% случаев. Относительное содержание незначительное и составляет 7,32±2,17.
Соотношения видового состава микрофлоры девочек нейтрального возраста