единицы измерения coi что это
BAU-эффект: как пересчитать антитела к коронавирусу по шкале ВОЗ
После того как ВОЗ утвердила международные единицы (BAU/мл), в которых нужно считать антитела к коронавирусу, Росздравнадзор обратился к медицинским организациям и создателям тестов с требованием о пересчете. Как объяснили «Известиям» эксперты, стандартизация необходима, так как до настоящего времени количество антител к SARS-CoV-2 измеряли в разных единицах. И вполне может получиться, что значение «13», полученное с помощью одного теста, больше значения «300», полученного с помощью другого. Единая система подсчета антител требуется и для того, чтобы понимать, как защищены люди в разных странах. Например, по словам директора Центра имени Гамалеи Александра Гинцбурга, достаточно 300 BAU, чтобы быть полностью защищенным от штамма «Дельта». А вот по мнению министра здравоохранения РФ Михаила Мурашко, достоверно определить уровень антител, достаточный для защиты от коронавирусной инфекции, пока нельзя.
Считаные единицы
В ходе пандемии COVID-19 ВОЗ столкнулась с проблемой различия между тестами на антитела. Оказалось, что разные производители определяют количество антител в «собственных» единицах, поэтому при сравнении результатов нередко возникает путаница. Поэтому организацией был принят международный стандарт — единицы измерения антител к SARS-CoV-2 — BAU/мл (binding antibody units, единицы связывающих антител. — «Известия»).
Вскоре Росздравнадзор опубликовал письмо к субъектам обращения медицинских изделий, руководителям территориальных органов Росздравнадзора, медицинским организациям, а также органам управления здравоохранением субъектов Российской Федерации. В нем ведомство говорит о необходимости представлять результаты исследований антител к коронавирусу с использованием условных единиц BAU.
Там же размещен список тестов (сейчас их шесть), для которых официально получен коэффициент пересчета в единицы ВОЗ.
В частности, в документе упоминаются три распространенные в РФ системы — их производят итальянская компания «ДиаСорин», немецкая «Рош Диагностике» и ирландская «Эбботт». Результат «ДиаСорин» переводится в BAU/мл умножением на 2,6, «Эбботт» — умножением на 0,142, а «Рош Диагностике» — делением BAU/мл на 0,972.
С помощью тестов «Эбботт» анализ тестов на уровень антител IgG к SARS-CoV-2 определяют компании «Инвитро» и «Гемотест», «Хеликс» использует «ДиаСорин», клиника «Альфа-Центр Здоровья» — Рош Диагностик.
— Приведение результатов тестов к единой системе позволит сравнивать их между собой, — пояснил научный сотрудник лаборатории биокатализа ИБХ РАН вирусолог Георгий Скрябин. — Если объяснять метафорично, разные организации измеряют количество антител к SARS-CoV-2 в разных единицах — это как расстояние можно мерять в фунтах, сантиметрах, ярдах. И вполне может получиться так, что значение «13», полученное с помощью одного теста, больше значения «300», полученного с помощью другой системы. Поэтому такая стандартизация значительно облегчит жизнь пациентам и врачам. Например, с помощью такого стандарта будет проще определить, какой уровень антител все-таки нужен для защиты от заражения COVID-19, а пациентам будет проще сравнивать данные тестов.
BAU показывают, насколько сильно антитела связываются с конкретным белком вируса, поясняет Георгий Скрябин. Вирус связывается с клеткой рецептор-связывающим доменом S-белка. Поэтому можно говорить, что если связывание хорошее, то и защита будет хорошая. Этот метод определения количества антител хорошо работает в случае вакцинированных «Спутником V», отметил эксперт.
Недавно директор Центра имени Гамалеи Александр Гинцбург заявил, что 300 единиц антител (BAU) защищают от «Дельты» полностью. Если у человека 500 единиц и больше, то это идеально для защиты от заражения COVID-19, сообщил он. Свое утверждение академик основывает на результатах совместного с департаментом здравоохранения Москвы исследования — в нем приняли участие 4 тыс. москвичей.
Однако министр здравоохранения РФ Михаил Мурашко на заседании комитета Госдумы по охране здоровья отметил: уровень антител, достаточный для защиты от коронавирусной инфекции, достоверно определить пока нельзя.
Правила игры
Полный перечень зарегистрированных в РФ тест-систем для выявления коронавирусной инфекции намного шире, чем опубликованный Росздравнадзором. «Известия» выяснили, как отечественные компании будут справляться с переводом полученных результатов в единицы ВОЗ. Для перевода в международные единицы организация утвердила стандарт измерения. Он представляет собой некий эталон — подобно метру или килограмму. Чтобы создать его, ученые взяли плазму крови у переболевших COVID-19 людей и смешали полученные образцы. Далее их особым методом высушили и поместили в ампулы.
Чтобы привести свою систему к международным единицам, компания должна приобрести такую ампулу. Далее ее необходимо развести в дистиллированной воде и провести тест на антитела. Исходя из соотношения BAU (которое известно) и результата теста самой компании, можно получить коэффициент для пересчета.
Антитела к коронавирусу через 9 месяцев
Очередной выезд из Казахстана, очередной ПЦР и как обычно сдаем анализы на антитела к коронавирусу. Прошло уже 9 месяцев с момента заболевания. Предыдущий тест на антитела мы сдавали перед новым годом, результаты можно посмотреть по ссылке Антитела через 6 месяцев. Что-то пошло не так.
В комментариях к прошлому отчету разгорелась дискуссия, насколько можно ориентироваться на показатель COI (cut-off index) для отслеживания динамики. COI это расчетный индекс, зависящий от многих факторов и прямое сравнение цифр даже у одного человека может быть не корректным. Но может быть и корректным :))
Мы сдаем все тесты в одной сети и пока динамика COI соответствует ожиданиям. Вот результаты мартовского теста:
Итого в динамике картина получается следующая:
Месяц | COI Владимир | COI Александра |
---|---|---|
Июль 2020 | 20.43 | 36.0 |
Сентябрь 202 | 119.0 | 108.5 |
Ноябрь 2020 | не сдавал | 75.12 |
Декабрь 2020 | 93.89 | 52.86 |
Март 2021 | 63.94 | 46.98 |
Комментарий от лаборатории к тесту на антитела к коронавирусу:
Значение COI (cut-off index) 1,0 и более свидетельствует об обнаружении суммарных антител (включая IgM и IgG) к коронавирусу и прямо пропорционально их количеству. Величина COI не зависит от тяжести заболевания, а характеризует степень иммунного ответа. Показатель COI
индивидуален и может оцениваться в динамике только у одного и того же пациента. Для мониторинга увеличения или снижения количества
антител оценку результатов следует проводить на одних и тех же приборах, в одной и той же лаборатории. Недопустимо сравнивать результаты, полученные разными методами: ЭХЛ, ИФА, ИХА (экспресс-тест), а также уровень COI между разными пациентами. Полученные результаты необходимо сопоставлять с давностью появления симптомов заболевания и наличием их в данный момент.
Наличие суммарных антител позволяет подтвердить диагноз коронавирусной инфекции при отрицательном результате ПЦР.
Отсутствие суммарных антител возможно в начальном периоде инфекции до формирования иммунного ответа.
Остается несколько моментов:
Антитела к коронавирусу: как правильно прочитать результаты исследований
В официальной группе «Сыктывкарской скорой медицинской помощи» опубликована разъяснительная статья об антителах к коронавирусу.
Коронавирусная инфекция изменила жизнь каждого из нас. Инфекция часто протекает без симптомов или в лёгкой форме. Как узнать, переболел я или нет (ведь кашлял же зимой)? Являюсь ли безопасным для окружающих? Могу без страха навещать бабушку, маму, друзей? Эти и другие вопросы волнуют многих людей. Прошло достаточно времени чтобы появилась возможность ответить на них. Для оценки возможного иммунитета есть скрининговое исследование на антитела к коронавирусу (IgM и IgG).
Что такое антитела к коронавирусу
Антитела, или иммуноглобулины – специальные белки, которые вырабатывает иммунная система в ответ на попадание любого инфекционного агента, в том числе CoV-2 в организм человека, даже если не было ярких признаков болезни. Антитела распознают коронавирус, обезвреживают и сохраняют информацию об инфекции на случай новой встречи с инфекцией.
Как образуются антитела
На первой неделе заболевания начинают синтезироваться иммуноглобулины М (IgM). Они первыми встречаются с инфекцией, поэтому считаются маркерами острой первичной инфекции. Однако, тест на определение антител класса М может давать неспецифическую реакцию, что в ряде случаев приводит к ложноположительному результату. Поскольку на антитела класса М возложена ответственность первыми начать отражать инфекцию и сделать максимально быстро, то эти белки не очень специфичны и могут не очень точно улавливать вирус.
К неспецифической реакции с тест- системой могут привести процессы, связанные с воспалением в организме: острые и хронические воспалительные процессы, аутоиммунные заболевания, проблемы с щитовидной железой, беременность и так далее. Это называется «ложноположительный» результат.
При стандартном инфекционном заболевании (в том числе и при коронавирусной инфекции) обычно антитела IgM через месяц исчезают, заменяясь на более специфичные антитела IgG. Однако учёные выяснили, что при коронавирусе IgM могут сохраняться длительное время (до 1,5-3 месяцев от появления симптомов, когда уже сам вирус давно не обнаруживается).
Иммуноглобулины А (IgA) также вырабатываются в острый период инфекции. Их основная цель – защитить слизистые оболочки от коронавируса. IgA более избирательны (специфичны), вырабатываются строго на коронавирус. Их уровень снижается после выздоровления, примерно к 1,5- 2 месяцам после инфицирования.
Иммуноглобулины G (IgG) синтезируются последними, через 5-6 недель с момента попадания вируса в организм, и сохраняют информацию о коронавирусе. Обычно IgG являются архивом памяти перенесеных инфекций, в большинстве случаев пожизненно, либо на несколько лет. Механизмы развития иммунной реакции на коронавирус пока изучаются. Неясно, стойкий иммунитет формируется или нет. Это предстоит узнать. Но в любом случае, выявление IgG свидетельствует о факте попадания коронавируса в организм и иммунном ответе организма.
Кому показаны тесты на определение антител к новой коронавирусной инфекции
— Тем, кто хочет узнать, перенес он инфекцию или нет независимо от того, были признаки простуды или не было. Только следует понять, что если были подозрительные признаки, целесообразнее обследоваться на IgG спустя 5 недель от предполагаемого периода. Если признаков не было, сроки неважны, обследуйтесь в любое время.
— Тем, кто подозревает течение коронавирусной инфекции сейчас или перенес в недавнее время, даже если проводили исследование мазка из зева методом ПЦР и он показал отрицательный результат. Иногда такое бывает.
О каждом исследовании по порядку
Антитела IgM/IgG к вирусу SARS-CoV-2.
Это комплексный тест, определяет иммуноглобулины классов М и G, результат по каждому антителу. Выполняется иммунохроматографическим методом (ИХГА). Ответ выдаётся в формате «обнаружено/не обнаружено».
Как понимать результат исследования
Если Ig M (+) обнаружены, IgG (-)не обнаружены:
Может быть признаком острой инфекции, особенно при наличии признаков заболевания.
Возможен ложноположительный результат (при хронических заболеваниях)
Поэтому целесообразно провести исследование мазка из зева методом ПЦР. Если результат ПЦР отрицательный или нет признаков болезни, повторить тест на антитела через 2-3 недели.
Если IgM (+) обнаружены, IgG (+) обнаружены:
Возможна текущая инфекция, начало выздоровления или недавно перенесенное заболевание
Если IgM (-) не обнаружены, IgG (+) обнаружены:
Свидетельствует о перенесенном ранее COVID-19
Если IgM (-) не обнаружены, IgG (-) не обнаружены:
Пациент еще не встречался с вирусом
Антитела IgA к коронавирусу SARS-CoV-2
Тест выполняется методом ИФА на анализаторе, производитель Евроиммун, Германия. Результат выдается в виде цифрового значения (коэффициент позитивности = КП).
IgA – показатели ранней инфекции, являются более точными в отличие от IgM, поскольку более специфичны.
Как правильно прочитать результат
Положительный результат – более 1,1. Говорит об обнаружении IgA и может означать:
Текущую инфекцию сейчас (в частности, бессимптомное течение)
Если одновременно определяются IgG, то это период выздоровления или недавно перенесенная инфекция
Пограничный результат – в интервале 0,8 – 1,1. Требует повторного исследования через 2 недели, поскольку может означать:
— Начальный период инфекции, когда не успели сформироваться антитела в достаточном количестве. Как правило, в таком случае есть признаки болезни и требуется подтверждение методом ПЦР (мазок из зева). Тогда через 2 недели будет отмечаться нарастание IgA.
Отрицательный результат –менее 0,8. Означает отсутствие антител IgA, что возможно, если:
— Пациент не встречался с коронавирусом SARS-CoV-2
Самое начало болезни, когда ещё нет иммунного ответа. При наличии проявлений правильно исследовать мазок из зева на ПЦР.
Антитела IgG к коронавирусу SARS-CoV-2
Исследование выполняется на анализаторе методом ИФА, производитель Евроиммун, Германия. Результат в виде цифрового значения (коэффициент позитивности = КП).
Расшифровка результатов:
Положительный результат –более 1,1. IgG выявлены, а это может быть в следующих случаях:
— Сформирован иммунитет после давно перенесенной инфекции. Тогда антитела IgM и IgA отсутствуют
— Текущая инфекция в стадии выздоровления или недавно перенесенная – если определяются одновременно IgA и/или IgM
Пограничный результат –в интервале 0,8 – 1,1.
Возможно, IgG ещё немного, что требует повторить исследование через 2 недели и возможно, когда:
— Инфекция протекает менее 5-6 недель. Тогда есть признаки болезни, может быть положительный ПЦР и антитела IgM, IgA. Антитела IgG при повторном исследовании в таком случае возрастут.
— Неспецифическая реакция иммунной системы (очень редко). Тогда повторно тест будет отрицательный.
Отрицательный результат –менее 0,8.
IgG не обнаружены. Может быть, если:
— Не было встречи с SARS-CoV-2 (тогда нет IgA, IgM)
— Острая инфекция. При наличии проявлений следует проверить IgA, IgM и мазок на ПЦР.
Обнаружение антител IgG к коронавирусу SARS-CoV-2
Выполняется методом ИФА, методика автоматизированная, тест-системы российского производства. Заключение в виде цифры (коэффициент позитивности)
Референсные значения:
менее 0,9 – отрицательный результат
0,9 – 1,0 – пограничный результат
более 1,0 – положительный результат
Выявление антител класса IgG говорит о наличии иммунного ответа на встречу с инфекцией в прошлом и является признаком перенесенного заболевания.
СОДЕРЖАНИЕ
Теория
Целью подсчета на чашке является оценка количества присутствующих клеток на основе их способности давать рост колонии в определенных условиях питательной среды, температуры и времени. Теоретически одна жизнеспособная клетка может дать начало колонии путем репликации. Однако одиночные клетки являются исключением в природе, и, скорее всего, прародителем колонии была масса клеток, депонированных вместе. Кроме того, многие бактерии растут цепочками (например, стрептококки ) или скоплениями (например, стафилококки ). Оценка микробного числа по КОЕ в большинстве случаев занижает количество живых клеток, присутствующих в образце по этим причинам. Это связано с тем, что подсчет КОЕ предполагает, что каждая колония является отдельной и основана на одной жизнеспособной микробной клетке.
Предварительное понимание микроскопической анатомии организма может дать лучшее понимание того, как наблюдаемые КОЕ / мл соотносятся с количеством жизнеспособных клеток на миллилитр. В качестве альтернативы в некоторых случаях можно уменьшить среднее количество клеток на КОЕ, взбалтывая образец перед проведением разведения. Однако многие микроорганизмы являются хрупкими и страдают от уменьшения доли жизнеспособных клеток при помещении их в вихрь.
Обозначение журнала
Концентрации колониеобразующих единиц могут быть выражены с использованием логарифмической записи, где указанное значение представляет собой десятичный логарифм концентрации. Это позволяет вычислить логарифмическое сокращение процесса дезактивации как простое вычитание.
Использует
Колониеобразующие единицы используются для количественной оценки результатов во многих микробиологических методах посева и подсчета, включая:
Однако с помощью методов, требующих использования чашки с агаром, нельзя использовать жидкий раствор, потому что чистота образца не может быть неидентифицирована, и невозможно подсчитать клетки в жидкости по одной.
Инструменты для подсчета колоний
Подсчет колоний традиционно выполняется вручную с помощью ручки и счетчика щелчков. Обычно это простая задача, но она может стать очень трудоемкой и отнимать много времени, когда необходимо перечислить много пластин. В качестве альтернативы можно использовать полуавтоматические (программные) и автоматические (аппаратные + программные) решения.
Программное обеспечение для подсчета КОЕ
Колонии можно подсчитать по фотографиям тарелок с помощью программных средств. Экспериментаторы обычно фотографируют каждую тарелку, которую им нужно посчитать, а затем анализируют все изображения (это можно сделать с помощью простой цифровой камеры или даже веб-камеры). Поскольку для получения одного снимка требуется менее 10 секунд, в отличие от нескольких минут для подсчета КОЕ вручную, такой подход обычно экономит много времени. Кроме того, он более объективен и позволяет извлекать другие переменные, такие как размер и цвет колоний.
В дополнение к программному обеспечению, основанному на традиционных настольных компьютерах, доступны приложения для устройств Android и iOS для полуавтоматического и автоматического подсчета колоний. Встроенная камера используется для фотографирования чашки с агаром, а внутренний или внешний алгоритм используется для обработки данных изображения и оценки количества колоний.
Автоматизированные системы
Многие из автоматизированных систем используются для противодействия человеческой ошибке, поскольку многие методы исследования, выполняемые людьми, подсчитывающими отдельные клетки, имеют высокую вероятность ошибки. Из-за того, что исследователи регулярно вручную подсчитывают клетки с помощью проходящего света, этот метод, подверженный ошибкам, может существенно повлиять на расчетную концентрацию в основной жидкой среде, когда количество клеток мало.
Некоторые автоматизированные системы, такие как системы MATLAB, позволяют подсчитывать клетки без необходимости их окрашивания. Это позволяет повторно использовать колонии для других экспериментов без риска уничтожения микроорганизмов пятнами. Однако недостатком этих автоматизированных систем является то, что чрезвычайно трудно отличить микроорганизмы с пылью или царапинами на пластинах с кровяным агаром, потому что и пыль, и царапины могут создавать самые разнообразные комбинации форм и внешнего вида.
Альтернативные единицы
Вместо колониеобразующих единиц можно использовать параметры наиболее вероятного числа (MPN) и модифицированных единиц Фишмана (MFU). Метод наиболее вероятного числа позволяет подсчитывать жизнеспособные клетки и полезен при подсчете низких концентраций клеток или подсчете микробов в продуктах, в которых наличие твердых частиц делает подсчет на планшете нецелесообразным. В модифицированных единицах Fishman учитываются жизнеспособные, но не культивируемые бактерии.
КОЕ/мл – что это значит?
Человек нередко сталкивается с незнакомыми единицами измерения. Одной из таких непонятных величин является КОЕ. Мы можем встретить такое обозначение на упаковке молочнокислых продуктов (кефир, ряженка, снежок) или на препаратах-пробиотиках. Также единицы КОЕ/мл можно увидеть в результатах микробиологических лабораторных исследований.
Так что же обозначает это КОЕ и почему оно встречается в продуктах питания, лекарствах и результатах анализов? Давайте разбираться…
Аббревиатура КОЕ расшифровывается как «колониеобразующая единица» (англ. Colony Forming Unit или CFU) и обозначает число бактерий, которые способны сформировать полноценную микробную колонию. Обычно КОЕ определяют в 1 мл исследуемого субстрата – молочного продукта, лекарства или биологической жидкости. В результате получают показатель КОЕ/мл. Зачастую всего 1 микробная клетка способна образовать целую колонию.
Количество жизнеспособных бактерий определяют также в твердых телах и в воздухе, которые обозначают как КОЕ/г и КОЕ/м 2 соответственно.
Кстати, в гематологии термином КОЕ называют стволовую клетку, которая является предшественником всех клеток крови – эритроцитов, лейкоцитов, моноцитов, макрофагов, тромбоцитов и прочих.
Показатель КОЕ всегда достигает достаточно больших величин, например 1*10 4 (10 тысяч), 1*10 5 (100 тысяч), 1*10 6 (1 миллион) КОЕ/мл. При этом если речь идет о молочнокислом продукте или пробиотике, то нужно руководствоваться правилом «чем больше – тем лучше». Дело в том, что в таких продуктах и лекарствах находятся полезные лактобактерии и бифидобактерии – нормальные обитатели микрофлоры кишечника.
Следует заметить, что 1 миллион молочнокислых бактерий – это не так уж и много по сравнению с объемами нормальной микрофлоры. К примеру, в 1 мл содержимого толстой кишки содержится от 10 миллиардов (1*10 10 ) до 1 триллиона (1*10 12 ) полезных бактерий. А общая масса микрофлоры человека достигает 1-3 кг. На этом фоне 1 миллион уже не кажется большим количеством.
Обратная ситуация обстоит при заболеваниях, когда необходимо сдавать анализы на болезнетворные бактерии. Они не являются нормальными обитателями нашего организма, поэтому здесь действует правило: «чем меньше – тем лучше».
Состав нормальной микрофлоры кишечника
У здоровых людей в кишечнике насчитывается от 500 до 1000 видов различных бактерий, которые живут в симбиозе с человеком. Они выполняют массу полезных свойств, без которых человеку попросту не обойтись:
Все эти функции выполняют триллионы бактерий, которые работают для здоровья организма. Без этих невидимых помощников наша жизнь, похоже, была бы невозможна. Поэтому нужно знать своих героев в лицо. Нормальную микрофлору кишечника формируют следующие группы бактерий:
Эти 4 группы микроорганизмов составляют костяк нашей микрофлоры и занимают до 90% её объема.
Бактерии №5-10 являются факультативными (необязательными) для нормофлоры кишечника. К тому же они являются условно патогенными и при неблагоприятных обстоятельствах могут вызывать заболевания. Однако у большинства людей они занимают не более 10% от всего объема микрофлоры.
Микроорганизмы №11-21 являются транзиторными (временными). Они не выполняют особо важных функций. В норме их объем составляет 0-1% от массы нормофлоры.
Теперь Вы знаете, что такое КОЕ и можете определить пользу либо вред большого количества микроорганизмов в продуктах питания, лекарствах или в результатах микробиологического анализа. Берегите свою микрофлору, поскольку это важный компонент полноценного здоровья.
Более подробно об авторах этой статьи.