как узнать каким штаммом коронавируса переболел ковид
Так ли страшны новые штаммы? Ответы на самые важные вопросы о мутациях коронавируса
Появление новых штаммов коронавируса, имеющих необычные свойства, вызывают тревогу людей во всем мире. Руководитель научной группы разработки новых методов диагностики заболеваний человека Центрального научно-исследовательского института эпидемиологии Роспотребнадзора Камиль Хафизов рассказал о том, что сейчас известно о мутациях COVID-19 и нужно ли будет ежегодно от него прививаться, как мы это делаем в случае с гриппом.
— Сколько всего штаммов коронавируса выявлено на сегодняшний день в мире?
— В первую очередь стоит обратиться к определению штамма вируса как некоторого варианта патогена, который обладает уникальными и стабильными фенотипическими характеристиками. При этом стоит отметить, что вирусы, особенно РНК-содержащие, постоянно мутируют, перебирая разные варианты изменений в геноме, и даже внутри одного человека может содержаться множество версий одного вируса, отличающихся отдельными изменениями в геноме, которые далеко не всегда приводят к образованию нового штамма.
Варианты SARS-CoV-2 циркулируют во всем мире, и после появления некоторые варианты довольно быстро исчезают, другие, наоборот, закрепляются в популяции, процесс динамический. Сколько всего штаммов нового коронавируса существует в природе на данный момент, неизвестно, в том числе из-за размытости самого понятия и факта того, что свойства многих геновариантов вируса пока не изучены.
Так, популярный ресурс PANGO lineages выделяет значительное число отдельных линий патогена, и различные организации во всем мире изучают варианты вируса, чтобы понять, являются ли они более контагиозными, изменяющими тяжесть течения заболевания, детектируемыми доступными диагностическими тестами, отвечающими на терапию, изменяющими эффективность вакцин против COVID-19 и т.п. Потому куда чаще термин «штамм» используется для каких-то особо интересных вариантов патогена, как, например, британского или южноафриканского, которые характеризуются ключевыми изменениями в геноме и имеют важные (часто выгодные патогену) свойства. Так, было введено понятие VoC (от англ. Variants of Concern. — Прим. ред.) — «варианты, вызывающие беспокойство», к которым сейчас причисляют несколько штаммов, включая вышеперечисленные.
— Сколько из них есть в России?
— Строгого ответа нет. Какая-то доля всех штаммов коронавируса, которые распространяются на планете, есть уже и в России, какие-то будут завезены в будущем, какие-то появятся у нас в стране независимо. Ученые во многих лабораториях в мире и в нашей стране сейчас проводят активную работу по секвенированию геномов патогена из различных регионов, чтобы как можно быстрее выявлять новые варианты, мониторить скорость их распространения, устанавливать источники заносов из-за рубежа, определять свойства, корректировать тест-системы в случае необходимости. Из известных штаммов в РФ были выявлены британский, южноафриканский, индийский и несколько локальных.
— Какие штаммы коронавируса самые опасные и проникают внутрь всего организма, а какие — наоборот?
— Как уже говорил выше, само определение штамма подразумевает новые стойкие свойства патогена. Чаще всего приходится иметь дело либо с повышенной заразностью вируса (как, например, в случае с британским штаммом, который, по различным оценкам, примерно на 50% более заразен, чем другие, «старые» версии), либо же со снижением эффективности связывания с нейтрализующими антителами, возникшими после вакцинации или перенесенного ранее заболевания (так в случае с южноафриканским вариантом).
При этом сразу хотел бы отметить, что уменьшение эффективности вовсе не означает отсутствие защиты, но она может быть несколько снижена. В любом случае всячески выступаю за вакцинацию, которая если и не защитит на 100% от заболевания, то может кардинально снизить тяжесть его протекания.
— Какие штаммы наиболее всего распространены в Москве, какими больше всего болеют в России?
— За последнее время мы видим несколько сотен завозов британского штамма как по России, так и в Москве, что вполне ожидаемо ввиду его свойств. Появляются и некоторые локальные российские версии вируса, у которых встречаются мутации в геноме, характерные для британского и южноафриканского вариантов, но пока преждевременно говорить о том, что они действительно обладают какими-то особыми для людей свойствами. По этой же причине мы не хотели бы сейчас раздавать новые имена таким вариантам, по крайней мере до накопления достаточного объема данных.
— От всех ли штаммов болезнь длится одинаково или есть разница?
— В какой-то момент появилась информация, что пациенты с британским вариантом инфекции болеют тяжелее, и летальность в таких случаях выше. Это впоследствии было опровергнуто другими исследованиями, и с тех пор я не видел новой информации. Похожая информация появлялась и про калифорнийский вариант.
Нужно отметить, что тяжесть протекания заболевания зависит от множества факторов, и, как известно, многие вообще переносят болезнь бессимптомно, кто-то же крайне тяжело. Такие факторы, как наличие сопутствующих заболеваний, общее состояние организма, возраст, играют существенно большую роль в развитии тяжелой болезни, чем наличие мутаций в геноме патогена, по крайней мере известных на данный момент.
— Может ли бы такое, что к одному штамму коронавируса у человека есть иммунитет, а к другому нет?
— Перенесенная ранее коронавирусная инфекция или вакцинация в норме вызывают иммунный ответ, и в результате в организме появляются нейтрализующие антитела, хотя защита обусловлена не только ими, потому не стоит пугаться, даже если уровень антител невысок или падает. Но да, мы уже знаем, что ряд мутаций в геноме нового коронавируса приводит к изменениям в структуре его белков, придавая патогену новые свойства, иногда удачные для патогена, в том числе с точки зрения снижения связывания нейтрализующими антителами. Потому точно ответить, что к одному штамму у человека есть иммунитет, а к другому нет, нельзя, но эффективность защиты может быть разной, в зависимости от того, с каким новым вариантом вируса вновь встретился пациент.
В связи с этим достаточно вероятна ситуация, что вакцины против нового коронавируса придется периодически обновлять и иммунизироваться ежегодно, как это сейчас происходит с тем же вирусом гриппа. Думаю, к осени мы накопим достаточное количество данных по эффективности существующих вакцин против новых штаммов. Потому еще раз говорю: на данный момент известных причин избегать вакцинации нет, если только нет прямых противопоказаний по состоянию здоровья.
Альфа, бета, гамма, дельта: Какие варианты коронавируса выделены и чем они отличаются
Третья волна пандемии ковида в России неразрывно связана с так называемым «индийским штаммом», он же дельта-вариант. Что в нём особенного и чем он отличается от других, разбирался «Царьград Новосибирск»
Пандемия коронавируса продолжается уже около полутора лет. За это время человечество изобрело вакцины и разработало эффективные методики противостояния болезни. Но и вирус не стоит на месте, а постоянно мутирует, адаптируясь к новым условиям и меняя свои свойства от варианта к варианту.
В начале июля гендиректор вирусологического центра «Вектор» Ринат Максютов заявил о том, что в России на сегодняшний день гуляет около 16 тыс. различных мутаций коронавируса. Правда большинство из них мало отличается друг от друга, и разница представляет интерес только для учёных.
По-настоящему важно знать о вариантах вируса, иногда ошибочно именуемых штаммами. ВОЗ выделяет четыре наиболее опасных на сегодняшний день варианта коронавируса, распространённые по всему миру. Все они появились много позже начала пандемии и отличаются куда большей агрессивностью, а в некоторых случаях и смертоносностью.
Альфа-вариант (Британский)
Впервые был выявлен в графстве Кент (Великобритания) в сентябре 2020 года. Примерно на 90% заразнее исходного коронавируса, пришедшего из Китая. Является одним из самых распространённых в странах Европы вариантов коронавируса, а вот в России представлен гораздо слабее. Первый случай был зарегистрирован в январе 2021 года у пассажира самолёта. При этом до появления дельта-варианта именно с британским вариантом связывал свои самые сильные опасения Роспотребнадзор.
Вызываемый альфа-вариантом ковид, как и во всех остальных вариантах, проявляется высокой температурой, сухим кашлем и потерей вкуса. При этом врачи отмечают, что кашель от альфа-варианта, а также боль в горле случаются на 30% чаще, чем у заразившихся исходным коронавирусом. С другой стороны, вкус и обоняние такие пациенты теряют на 39% реже. Кроме того, учёные выяснили, что заразившиеся альфа-вариантом на 64% чаще нуждаются в госпитализации, а вероятность смертельного исхода у них гораздо выше.
Тем не менее, против альфа-варианта эффективны все существующие вакцины.
Бета-вариант (Южноафриканский)
Выявлен в октябре 2020 года в столичном муниципалитете Нельсона Манделы (ЮАР) и именно в странах Африки пока что имеет наибольшую распространённость. В России на июнь 2021 года бета-вариант выявлен лишь в 6%. С другой стороны исследования показали, что именно этот вариант больше других тяготеет к молодым людям, поскольку лучше умеет прикрепляться к клеткам организма.
От обычного коронавируса отличается большей заразностью и живучестью – благодаря мутациям этот вариант умеет «ускользать» от нейтрализующих антител. Тем не менее, вакцина «Спутник V», по данным исследователей из США и Аргентины, всё ещё эффективна против него, хотя и не настолько, как против оригинального варианта.
Гамма-вариант (Бразильский)
Этот вариант открыли 6 января 2021 года, а первыми заболевшими стали четыре японца, отдыхавшие в бразильском штате Амазонас. Именно гамма-вариант стал причиной второй волны коронавируса в столице штата, городе Манаус. Что немало говорит о его заразности – около 70% жителей города ранее переболели оригинальным вариантом коронавируса и имело антитела.
Вызываемая им болезнь имеет стандартные симптомы ковида, но сам вирус минимум втрое заразнее исходного варианта, к тому же умеет преодолевать естественный иммунитет у переболевших. Также установлено, что гамма-вариант сильнее бьёт по молодёжи и особенно по беременным.
В России гамма-вариант пока представлен единичными случаями. Как заявили 22 июля представители центра «Вектор», во всей стране выявлено всего несколько случаев гамма-варианта. Зато этот вариант на сегодняшний день стал самым популярным в США, об этом заявил американский Центр по контролю и профилактике заболеваний.
Также гамма-вариант сильно распространён на своей родине, в Бразилии. Этому немало поспособствовал президент страны Жаир Болсонару, открытый антипрививочник и ковид-диссидент. В результате на пике заболеваемости рухнула национальная система здравоохранения, а кладбища быстро оказались переполненными.
Дельта-вариант (Индийский)
Главный отрицательный герой новостной повестки лета 2021 года. Впервые выявленный весной 2021 года, он быстро добрался до других стран, в том числе до России. Глава Роспотребнадзора Анна Попова даже заявляла, что именно дельта-вариант стал самым распространённым вариантом коронавируса в мире. ВОЗ рекомендовала государствам вновь закрыть авиасообщение, но для России и ещё 63 стран было уже слишком поздно.
Интересно, что некоторые индийские СМИ заявили, что на самом деле дельта-вариант пришёл в Индию из Великобритании, а не наоборот, как гласит официальная версия.
От оригинального коронавируса дельта-вариант отличают чудовищные темпы распространения. По данным открытого российского консорциума по секвенированию геномов SARS-CoV-2, в мае 2021 года дельта-вариант был причиной ковида в 52% выявленных в стране случаев. А в середине июля его доля выросла до 90%.
Вариация ковида, вызываемая дельта-вариантом, от изначальной болезни также отличается симптомами. При течении средней тяжести врачи выделяют боли в суставах и животе, желудочные расстройства, сопровождаемые тошнотой и рвотой, высокую температуру, озноб с лихорадкой, потерю слуха, спутанность сознания и даже гангрену.
У пациентов, болеющих ковидом от дельта-варианта в лёгкой форме, медики наблюдают головные боли, боли в горле, высокую температуру, кашель и насморк. Крепкие здоровьем граждане и вовсе путали такой ковид с простудой.
От исходного коронавируса дельта-вариант отличается тем, что с ним не теряется обоняние. Но на смену ему пришла потеря слуха, а в самых плохих исходах – потеря конечностей. Всё из-за резко увеличивающегося риска возникновения тромбов.
Впрочем, для иностранцев самой страшной новостью стало то, что против дельта-варианта могут оказаться бесполезны вакцины производства AstraZeneca и Bharat Biotech. А медицинский журнал The Lancet пишет, что и препарат Pfizer может быть неэффективен.
Отечественные вакцины, в свою очередь, с дельта-вариантом справляются. Во всяком случае так заявили их разработчики. В защиту русских вакцин говорит и статистика – при огромной распространённости дельта-варианта в России, число заболевших среди вакцинированных составляет не более процента, что укладывается в приемлемые показатели эффективности вакцин.
Тайна бессимптомников раскрыта: Переболели COVID незаметно? Легко проверить
Есть ряд признаков, по которым можно распознать у себя перенесённый незаметно COVID-19. Сказав это, врач из Великобритании Дэн Банстоун удивил весь мир. Российские медики его раскритиковали, обозначив, что перечисленные Банстоуном симптомы – универсальные сигналы нездоровья. То есть встречаются при сотнях заболеваний. И сегодня есть куда более верные способы узнать, что человек переболел коронавирусной инфекцией.
Не путайте с интоксикацией
По словам Дэна Банстоуна, протекающий бессимптомно COVID обычно не означает полного отсутствия каких бы то ни было признаков. Следует обратить внимание на внезапную усталость, снижение физического тонуса, головные боли, ноющие мышцы или суставы. Если недомогание имело место и человек не простывал, не страдает от хронических недугов, то есть вероятность невыявленной коронавирусной инфекции.
На самом деле всё вышеперечисленное – симптомы интоксикации, считает врач общей практики ГБУ3 «Диагностический центр № 5 Департамента здравоохранения города Москвы» Денис Прокофьев.
При интоксикации повышается бактериальный фон, в результате в организме человека повышается уровень токсинов и идёт, так скажем, внутреннее отравление. Отсюда и головные боли, тяжесть в мышцах, ногах и так далее. Это и есть так называемая внутренняя интоксикация. А бессимптомное течение ковидной инфекции потому и носит название бессимптомного, что не сопровождается абсолютно никакими симптомами. То есть, в принципе, это абсолютно здоровый человек,
– поделился своей точкой зрения специалист.
Антитела есть, но переболел не ковидом
Без профессиональной диагностики определить, болеете ли вы или уже перенесли коронавирус, невозможно, отметил Денис Прокофьев. Сейчас есть два теста. Один – ИФА-диагностика, это мазок, который берётся изо рта. Исследование показывает острую фазу, то есть болеет сейчас человек или не болеет, заразен он или нет.
Ещё вариант – сдать кровь на ИФА. Так определяют иммуноглобулины, которые показывают наличие вируса внутри организма и присутствие иммунитета к нему.
«На сегодня есть три методики, если быть точным. Это мазок, это кровь и это компьютерная томография. На КТ есть яркие характерные признаки COVID, по которым можно ставить диагноз. Самому себе поставить диагноз коронавирусной инфекции невозможно – какой бы симптом вы не обнаружили», – добавил врач.
Между тем профессор, доктор медицинских наук, хирург высшей квалификационной категории Владислав Шафалинов считает чушью ПЦР-тестирование.
«Единственным, более-менее, с моей точки зрения, хорошим тестированием является тест на наличие антител. Но опять же, эти антитела вырабатываются не у всех, кто переболел коронавирусной инфекций. Перекрёстная реакция на иммуноглобулины встречается и у больных другими заболеваниями», – отметил профессор.
«Утомили открытиями…»
Что касается определения признаков бессимптомного течения болезни, тут Владислав Шафалинов также настроен скептически. Да, бывают случаи, когда у человека бессимптомно протекает, допустим, герпес, но при этом вирус в анализах всё же есть.
«В таком случае мы говорим, что это, условно говоря, носительство. Но не бессимптомное. Что касается британского доктора, большой привет британской медицине, их учёные за последнее десятилетие сильно утомили вообще всех новыми открытиями», – признался Владислав Шафалинов.
Он пояснил, что симптомы, которые перечислил доктор Банстоун, не являются специфичными для какого-либо заболевания. Они могут выдавать самые разные недуги – и инфекционные, и неинфекционные, а также онкологические и соматические. Кроме того, это могут быть признаки банального синдрома хронической усталости.
«Мир свихнулся на коронавирусе, уже любой симптом пытаются подогнать под него. Это, конечно, бред, чушь и отсутствие благоразумия», – заключил профессор.
Есть хитрый способ: «Работает блестяще»
Доктор медицинских наук, профессор, член президиума РАЕН, член Нью-йоркской академии наук, вирусолог Института им. Гамалеи Виктор Зуев рассказал, как в его случае выдавал себя так называемый бессимптомный COVID-19.
Я это всё прошёл, где-то коронавирус подхватил. Но у меня протекало бессимптомно, действительно. Чем сопровождалось? Я подкашливал. И у меня была такая желтоватая мокрота, и она у меня до сих пор. У меня, видно, какое-то ОРВИ, но я вообще мерзляв, я очень сейчас простужаюсь. Мне поставили тест, положительный оказался, то есть я был заражён. Я мерил температуру ежедневно: 36,6. Я болен?
– поделился Виктор Зуев.
По словам доктора медицинских наук, нездоровье может спровоцировать банальное плохое настроение.
«Доказано, что при снижении нашего настроения в организме начинаются биохимические процессы, продукты которых вредно влияют на наши внутренние органы. Так что надо бороться с плохим настроением. И шутка, что все болезни от нервов, содержит много правды», – подчеркнул вирусолог.
Он отметил, что сейчас есть огромное количество медицинских центров и диагностических лабораторий. Поэтому заниматься самодиагностикой явно не стоит. Лотерея и напрасная трата времени. Проще сдать анализ на антитела. Если они будут, значит, человек подцепил вирус.
«Также сейчас в аптеках продаются китайские наборы определения антител дома. И представьте, это не пустые слова. Я купил этот набор, чтобы провести это обследование своей собственной жене, которая в тот момент, когда надо было идти прививаться, не хотела, а когда захотела, у нас в Институте Гамалеи уже кончилась вакцина. Я сделал этот тест, ноль у неё антител, причём тест работает блестяще. Вот купите его, сделайте, это просто», – посоветовал Виктор Зуев.
То есть, как отмечают эксперты, прислушиваться к своему организму, конечно, необходимо. И стараться анализировать возможные причины «необъяснимого» нездоровья – дело важное. Однако ставить диагнозы на основе недомогания, поддавшись паническим настроениям, беспечно. Накручивание себя может обернуться появлением реальных проблем со здоровьем. Да и к чему гадать, если сегодня доступны способы диагностики с доказанной эффективностью.
В ВОЗ заявили о риске для переболевших COVID заразиться новыми штаммами
Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) располагает свидетельствами, согласно которым ранее переболевшие коронавирусом COVID-19 люди могут заразиться новыми штаммами инфекции. Об этом на брифинге заявила главный научный сотрудник ВОЗ Сумья Сваминатан.
«Сейчас мы получаем информацию о людях, повторно инфицированных новыми штаммами вируса. И поступили первоначальные сообщения из ЮАР, предполагающие, что люди, которые прежде были инфицированы, могут снова заразиться», — сказала она.
По ее словам, сейчас проводятся исследования, насколько хватает иммунитета от вируса у людей, которые уже переболели коронавирусом. Сваминатан также сообщила, что есть предварительные данные, согласно которым вакцинация снижает вирулентность инфекции и есть вероятность снижения уровня передачи COVID-19 после вакцинации.
Глава ВОЗ Тедрос Гебрейесус, выступая на брифинге, заявил, что пока рано отбрасывать какие-либо гипотезы о происхождении коронавируса COVID-19. «Некоторые вопросы возникли по поводу того, нужно ли отбраковывать некоторые гипотезы на этот счет. Переговорив с некоторыми членами [побывавшей в Ухане] команды, я хочу подтвердить, что все гипотезы остаются в силе и требуют дальнейшего анализа и изучения», — сказал он.
По его словам, миссия ВОЗ, посетившая Ухань, где в декабре 2019 года была выявлена первая вспышка коронавируса, добилась большего понимания начального этапа пандемии, а также наметила области для дальнейшей исследовательской работы. Гебрейесус сообщил, что на следующей неделе будет опубликован отчет о поездке экспертов в Ухань, а за ним последует финальный доклад.
Власти Великобритании сообщили об обнаружении нового, более заразного штамма коронавируса в середине декабря. Позже этот вариант SARS-CoV-2 обнаружили в ряде других стран, в том числе в США, Китае, Канаде, Турции, Таиланде, Греции, Словакии, Вьетнаме и на Кипре. По данным ВОЗ, его нашли в более чем 50 странах мира.
Еще одну более сильную мутацию COVID-19 в конце прошлого года обнаружили в ЮАР. По данным ученых из ЮАР, он примерно на 50% заразнее предыдущих мутаций, легче проникает в клетки человека и прочнее в них держится. Кроме того, этот генетический вариант коронавируса может быть опасен риском повторного заражения, а уже разработанные вакцины могут оказаться против него малоэффективными, предупредили ученые из Национальной лабораторной службы здравоохранения Йоханнесбурга.
В январе ВОЗ заявила, что возникновение этих новых вариантов коронавируса было ожидаемым, поскольку вирусам свойственно постоянно изменяться. Как сообщили в организации, сильные мутации инфекции также нашли в Бразилии и Японии. По данным ВОЗ, разновидность коронавируса VOC-202012/01 появилась в Великобритании в сентябре прошлого года, в ЮАР штамм 501Y.V2 присутствует с начала августа, а в Бразилии и Японии штамм P.1 циркулирует с декабря. Они, по версии организации, не взаимосвязаны.
Представитель Всемирной организации здравоохранения в России Мелита Вуйнович в интервью РБК говорила, что нужно быть готовыми к появлению штаммов, которые будут менее чувствительны к имеющимся вакцинам. «Конечно, надо быть осторожными, вирус мутирует, и он может поменять белок в любой момент. Антитела, которые у нас есть, могут просто промахнуться. Это можно сравнить с врагом, который попал в другую страну, но поменял форму, и мы не можем его идентифицировать. Надеемся, что вирус не будет часто менять свою форму», — заявляла она.
Пять новых штаммов коронавируса: чем опасны и чего от них ждать?
Гид по новым вариантам (штаммам) вируса, вызывающего COVID-19 и генетическим изменениям, которые могут сделать его более контагиозным и неуловимым для иммунной системы.
Когда прошлой зимой коронавирус SARS-CoV-2 ворвался в мир, ученым стало ясно, что дело плохо, но они посчитали, что вирус, по крайней мере, стабилен. Коронавирусы не мутируют так быстро, как, например, вирусы гриппа, гепатита или ВИЧ, — отчасти благодаря системе молекулярного редактирования, которую SARS-CoV-2 и родственные ему вирусы используют для предотвращения злокачественных генетических ошибок при репликации.
Но ученые были правы лишь наполовину. Вирус и правда не принес ничего хорошего — но оказалось, что и стабильностью он не отличается. С тех пор, как SARS-CoV-2 «перепрыгнул» с животных на людей, он накапливал незначительные случайные мутации: как однобуквенные «опечатки» в генетической последовательности вируса, так и вставки или выпадение более длинных фрагментов вирусной РНК. Большинство мутаций либо убивают вирус, либо никак не меняют его строение и поведение.
Но недавно было обнаружено несколько новых штаммов оригинального вируса (его также называют «вирусом дикого типа»), мутации которых, похоже, сильно влияют на его свойства, в том числе на контагиозность. Эти штаммы были обнаружены один за другим в разных географических регионах (Великобритания, ЮАР, Бразилия) и в некоторых случаях стали доминировать над штаммами, распространенными в этих регионах ранее. Одновременное появление сразу нескольких штаммов в поле зрения ученых частично объясняется улучшением технологий мониторинга случаев заражения и увеличением объемов секвенирования вирусов. Однако схожесть паттернов мутаций в новых штаммах может указывать на то, что эти изменения не случайны.
«Мы видим, как похожие мутации появляются в разных местах, — говорит Адам Лоринг, вирусолог из Мичиганского университета. — Это наводит на размышления о том, что они для чего-то нужны».
Пока что известно, что эти мутации помогают вирусу легче передаваться от человека к человеку и оставаться незамеченным иммунной системой. В январе ученые впервые сообщили, что антитела людей, переболевших COVID-19, не полностью нейтрализуют штамм вируса, обнаруженный в ЮАР. Кроме того, похоже, несколько человек, перенесших COVID-19, повторно заразились мутантным штаммом.
По последним данным, вакцины, производимые компаниями Moderna и Pfizer, скорее всего, защищают и от новых штаммов коронавируса. Разработчики «Спутника V» также заявили о его эффективности против мутировавшего вируса. Эффективность вакцин этих производителей превышает 90 %, поэтому, по мнению экспертов, даже при небольшом снижении этой цифры их все равно стоит использовать.
«Я рад, что это не лишает смысла [использование вакцин от COVID-19], но, очевидно, требует пристального внимания», — говорит Лоринг. Он добавляет, что на протяжении следующих лет компаниям, возможно, придется изменить эти вакцины и начать вводить пациентам новые их версии — подобно тому, как каждый год меняют вакцины от гриппа. Большинство вакцин вызывают намного более сильный иммунный ответ, чем естественное заражение вирусом. Во время клинических испытаний своей вакцины компания Moderna показала, что антитела, вырабатываемые после вакцинации, остаются в организме дольше, чем антитела, вырабатываемые при естественном заражении SARS-CoV-2.
по теме
Эпидемия
Вакцины, антитела, антигены. Гид по иммунологии для чайников
Ниже перечислены пять наиболее значимых штаммов коронавируса в порядке обнаружения учеными. В списке указано место первого выявления каждого из них и официальные названия штаммов или обозначения, используемые исследователями. (Разные группы исследователей используют разные способы обозначения штаммов, что вызвало путаницу. В этом списке использованы наименования, основанные на филогенетическом происхождении штаммов, но некоторые варианты вируса все равно имеют больше одного названия). Также здесь приведены важные мутации каждого штамма (названия мутаций состоят из букв и цифр, обозначающих позицию мутации в геноме вируса) и известная информация о том, что эти мутации делают.
Испания
Штамм 20A.EU1, впервые выделенный в Испании, содержит мутацию A222V в последовательности белка шипа. Шип — структура вируса SARS-CoV-2, которая связывается с рецепторами клеток ACE2 человека, помогая вирусу проникать внутрь этих клеток при заражении. Кроме того, именно с шипами связываются антитела человека, вырабатываемые для иммунного ответа на инфекцию. Лабораторные исследования показали, что человеческие антитела немного менее эффективно нейтрализуют вирусы с мутацией A222V. За несколько месяцев штамм 20A.EU1 стал доминирующим в Европе. Тем не менее эпидемиологи не наблюдали доказательств того, что этот штамм быстрее передается от человека к человеку, чем оригинальный вирус. Исследователи считают, что штамм, который на тот момент доминировал в Испании, распространился по всему континенту, когда в Европе начали ослаблять ограничения на перемещение.
Великобритания
Британские ученые наблюдали за штаммом B.1.1.7 некоторое время, прежде чем объявили в декабре, что он может передаваться как минимум на 50 % активнее, чем вирус дикого типа. Это заявление было основано на эпидемиологических данных, указывающих, что вирус нового штамма быстро распространяется среди населения, и привело к запретам на пересечение границ и усилению карантинных мер в Великобритании.
Штамм B.1.1.7 содержит 17 мутаций, некоторые из них затрагивают белок шипа. Было обнаружено, что одна из этих мутаций, N501Y, помогает вирусу прочнее связываться с рецепторами клеток ACE2. Однако пока неясно, обусловлена ли повышенная контагиозность данного штамма только этой мутацией или еще какими-либо изменениями структуры шипа.
Несмотря на первоначальное беспокойство, не было найдено подтверждений тому, что этот штамм более заразен для детей в сравнении с оригинальным, говорит Шерон Пикок, исполнительный директор Консорциума Великобритании по геномике COVID-19 (COG-UK), группы, анализирующей генетические изменения вируса. И Pfizer, и Moderna считают, что их вакцины от COVID-19 будут работать и против штамма B.1.1.7. Недавние данные из Великобритании указывают на то, что новый штамм может быть более летален по сравнению с диким типом, но это пока только предварительные результаты.
Штамм B.1.1.7 выделяется на фоне других, потому что он накопил так много мутаций. Лоринг и другие исследователи полагают, что эти мутации могли возникнуть при длительном заражении одного пациента с ослабленным иммунитетом, из-за чего организм пациента не мог побороть вирус. По словам Скотта Вивера, микробиолога из медицинского подразделения Техасского университета в Галвестоне, возможно, только некоторые из этих генетических изменений дали штамму эволюционное преимущество и позволили ему быстро распространиться по Великобритании. Остальные мутации просто остались в геноме за компанию.
Штамм B.1.351 появился в поле зрения ученых примерно в то же время, что и британский B.1.1.7. B.1.351 быстро распространился и стал доминантным вариантом вируса в ЮАР. Как и европейский штамм, B.1.351 содержит мутацию N501Y, хотя данные указывают, что два этих штамма возникли независимо друг от друга. Но ученых больше беспокоит другая мутация в африканском штамме, обозначаемая E484K. Это изменение в геноме, возможно, помогает вирусу избегать иммунного ответа и действия вакцин.
Эволюционный биолог и биоинформатик из Онкологического исследовательского центра Фреда Хатчинсона в Сиэтле Джесс Блум с командой с помощью клеток дрожжей создали серию вирусных белков-шипов, содержащих практически все из более 3800 возможных изменений в структуре, которые могут быть вызваны генетическими мутациями. Затем исследователи протестировали, насколько хорошо антитела связывались с каждым из этих видоизмененных шипов. Они обнаружили, что в результате мутации E484K и других похожих мутаций в этом конкретном участке белка антитела некоторых людей в 10 раз хуже связывались с шипами коронавируса. Команда Блума также показала, что некоторые коктейли из антител (подобные коктейли в настоящий момент тестируют фармацевтические и биотехнологические компании Regeneron и Eli Lilly) могут быть менее эффективными при наличии мутаций, которые имеются в штамме B.1.351.
В конце января ученые из ЮАР опубликовали препринт (научная статья, которая еще не прошла независимую рецензию), в котором показали, что сыворотка крови пациентов с COVID-19, содержащая антитела, значительно менее эффективно могла нейтрализовать новый штамм. В другом препринте, опубликованном 26 января, ученые сообщают, что они добавили вирус B.1.351 в сыворотку крови, взятую у людей, которым ранее ввели вакцину производства Pfizer или Moderna. В результате антитела в такой сыворотке проявляли сниженную нейтрализующую активность по отношению к мутантному вирусу в сравнении с вирусом дикого типа.
Однако антитела в пробирке — не то же самое, что вакцина в организме живого человека. В результате применения любой из упомянутых вакцин организм производит столько антител, что даже при сниженной активности их может быть достаточно для нейтрализации вируса. Вакцины также запускают работу других защитных механизмов иммунной системы. Тем не менее Moderna начала разработку бустерной вакцины, специфичной по отношению к новым штаммам.
Бразилия
В январе ученые сообщили об обнаружении двух новых вариантов коронавируса в Бразилии, происходящих от общего предка. Но хотя у этих двух штаммов есть общие мутации с вариантами, обнаруженными в других регионах, по всей вероятности, они возникли независимо.
Из этих двух штаммов ученых больше беспокоит P.1. Он содержит больше мутаций, чем Р.2 (хотя оба штамма имеют мутацию E484K), и уже был обнаружен в Японии и других странах. Возможно, Р.1 накопил свои мутации в организме пациента с ослабленным иммунитетом. Но генетик Эмма Ходкрофт из Бернского университета в Швейцарии говорит, что в этом случае может быть сложнее определить точное время и место возникновения штамма, поскольку в Бразилии секвенируют гораздо меньше образцов вируса, чем в Великобритании.
Ходкрофт отмечает, что в 2020 году и в Бразилии, и в ЮАР были крупные вспышки COVID-19. При таком большом количестве зараженных людей, вырабатывающих антитела к вирусу, штамм, способный избегать распознавания иммунной системой и повторно заражать уже переболевших людей, мог иметь значительное преимущество и широко распространиться в популяции.
Распространение и изменение вирусов
Хотя кажущееся внезапным появление нескольких вариантов белка шипа является причиной для беспокойства, по словам исследователей, пока нет доказательств, что коронавирус претерпел какие-либо принципиальные изменения, позволяющие ему мутировать быстрее. По мнению Лоринга, более вероятно, что большое число заражений COVID-19 по всему миру предоставляет вирусу множество возможностей для постепенных небольших изменений. Каждый зараженный человек — это, по сути, дополнительный шанс для возникновения нового штамма SARS-CoV-2. «Это имеет отношение к эволюции, но в первую очередь — это вопрос эпидемиологии», — говорит Лоринг. В целом «вирус совершенствуется в своей роли».